CRISPR/Cas9 Videos
Lerne mehr über Crispr/Cas9 und dessen Anwendung
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CRISPR Cas9- Eine kurze Einführung
Das CRISPR Cas9 System ist ein vielseitiges und robustes Genomeditiersystem, das Erfolge in verschiedenen Modellorganismen aufweist. In diesem Video werden Sie in die Technologie und ihre vielfältige Anwendung und ihre Auswirkungen auf die Genom-Editierung eingeführt. Was Sie erwartet:
- Aufschlüsselung der Technologie
- Mechanismen der Genom-Editierung
- Variationen des CRISPR Systems
- Cas9 Nickase
- Cas9 Nullmutant
- CRISPR Forschung
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2) CRISPR Cas9 - Methoden und Werkzeuge
Das CRISPR Cas9 System ist ein vielseitiges und robustes Genomeditiersystem, das Erfolge in verschiedenen Modellorganismen aufweist. In diesem Video erfahren Sie mehr über Methoden und Werkzeuge, darunter:
- Expression
- Nicht-virale Genübertragung (Lipidvermittelte Transfektion, Calciumphosphat Transfektion, Elektroporation)
- Variation to the CRISPR Systems
- Virale Genübertragung (Lentiviren, Adenoviren, Adeno-assoziierte Viren)
- Cas9
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3) CRISPR Cas9 - gRNA Design
Das RNA gesteuerte Cas9 System hat die Gentechnik durch gezielte Modifizierung des Genoms revolutioniert. Möglich macht dies das allein den Entwurf einer 20bp Sequenz. Diese Technologie verwendet eine Short-Guide-RNA, um die Cas9-Nuklease zu einem bestimmten genomischen Locus zu lenken. Die guide RNA ist zuständig für die Spezifität des CRISPR Cas9 Systems. Bei dem Prozess des Entwurfs einer RNA sollten einige Überlegungen berücksichtigt werden. Was Sie erwartet:
- crRNA, tracerRNA und gRNA
- Grundlegende Berücksichtigunge
- Gewünschte genomische Modifizierungen
- Werkzeuge für das gRNA Design
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4) CRISPR Cas9 - Genregulation mit dCas9
Das CRISPR Cas9 System ist ein vielseitiges und robustes Genomeditiersystem, das Erfolge in verschiedenen Modellorganismen aufweist. Eine neue Errungenschaft der Wissenschaft stellt das katalytisch tote Cas9 (dCas9) dar. Es ist in der Lage, sein Target mit hoher Spezifität zu binden, ohne DNA zu schneiden. Dieses neue CRISPR Cas9 System erweitert das Feld der reversiblen Genregulation um ein weiteres Werkzeug. Wie Sie in diesem Video erfahren, kann dCas9 als modulare Plattform fungieren, auf der Aktivatoren oder Repressoren einfach fusioniert und auf das Gen von Interesse ausgerichtet werden können. Was Sie erwartet:
- Kurzer Überblick über das CRISPR Cas9 System
- dCas9 Einführung
- dCas9 Systeme für Genaktivierung und Repression
- dCas9 Systeme für epigenetische Editierung
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Wie führe ich ein CRISPR Knockin Experiment durch?
Suchen Sie einen zuverlässigen und erschwinglichen Weg, um ein Gen-Knockin durchzuführen? In diesem Video wird das CRISPR Cas9 Geneditierungs-System genutzt, um das RFP-Gen in die AAVS1-Safe-Harbor-Stelle in HEK-Zellen einzuschleusen. Die Safe Harbor-Stelle ist eine bevorzugte Stelle für Gen-Knockins, da sie eine robuste Transgenexpression mit minimalen toxischen Wirkungen ermöglicht. Zunächst wird ein All-in-One-CRISPR-Cas9-sgRNA-Vektorkonstrukt entworfen, in dem die sgRNA auf den menschlichen AAVS1-Locus abzielt. Ein Spenderplasmid, das die Matrize für eine homologationsgerichtete Reparatur enthält, wird ebenfalls entworfen. Nach erfolgreicher Transfektion wird der Erfolg des CRISPR Cas9 Knockins mit einer PCR-basierten Technik verifiziert. Diese Technik verwendet kundenspezifische Primer, die auf eine Stelle innerhalb des RFP-Knockins abzielen. Der Knockin wird bestätigt, wenn ein PCR-Produkt sichtbar wird. Was Sie erwartet:
- Design eines All-in-One CRISPR Cas9 sgRNA Vektorkonstrukts mit der sgRNA für den menschlichen AAVS1 locus
- Design eines Spenderplasmids, das das Homologie-Template for HDR enthält
- Transfektion, Selektion und Expansion der erfolgreich editierten Zellen
- PCR Genotyping um den Knockin zu bestätigen
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Wie führe ich ein CRISPR Knockout Experiment durch?
Aufgrund der beispiellosen Benutzerfreundlichkeit und Erschwinglichkeit von CRISPR sind Gen-Knockout-Experimente jetzt praktikabler als je zuvor! In diesem Video erfahren Sie, wie das CRISPR Cas9-System verwendet wurde, um das LIF-Gen in einer Kolonkarzinom-Zelllinie auszuschalten. Um dies zu erreichen, wird ein Cas9 und sgRNA Lentivektor in die Zelle eingeschleust, darauf folgen Arzneimittelselektion und monoklonale Isolierung. Darüber hinaus erfahren Sie, wie Sie Ihren CRISPR-Knockout mithilfe des PCR-basierten Surveyor-Assays, der Sanger-Sequenzierung und der Next-Generation-Sequenzierung charakterisieren und verifizieren. Dieser vollständige Validierungsprozess stellt sicher, dass Ihre endgültige CRISPR Knockout-Zelllinie zu 100% erfolgreich ist. In dieser Fallstudie werden sie aufgeklärt über die folgenden Schritte:
- Einbringen der Cas9 und sgRNA
- Erste Selektionsrunde
- Sequenzanalyse
- Monoklonale Selektion
- Bestätigung des KOs durch NGS (Next Generation Sequencing)
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Wie führe ich ein bakterielles CRISPR Cas9 Knockout Experiment durch?
Obwohl das CRISPR System aus Bakterien stammt, wird es üblicherweise zur Editierung von eukaryotischen Genomen verwendet. Das liegt daran, dass die meisten Bakterien nicht in der Lage sind, die durch Cas9 induzierten DNA-Doppelstrangbrüche effektiv zu reparieren. Wissenschaftler haben daher eine Methode entwickelt, die die Rekombinationstechnologie mit CRISPR Cas9 kombiniert, damit auch Bakteriengenome bearbeitet werden können. Um diesen Vorgang zu demonstrieren, wird das CRISPR Cas9 System genutzt, um das CAT (chloramphenicol resistance cassette) Gen, zuvor in das Genom von E. coli am yeeR-Ort eingeführt wurde, auszuschalten. Dieser Prozess beinhaltet:
- Entwurf und Einbringen von sgRNA gegen die Zielstelle
- Entwurf und Einbringen eines repair templates
- Einbringen von Phagen-abgeleiteten (Lambda-Rot-) Rekombinasen zusammen mit Cas9, um die homologe Rekombination in Bakterien zu verbessern
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Wie ein Mini-CRISPR Cas9 System die Gentherapie revolutioniert
CRISPR saCas9 ist die kleine Schwester von spCas9, steht ihr aber in nichts nach. Haben Sie schon von saCas9 gehört? Es handelt sich um eine neuentdeckte Nuklease, die die Spielregeln für CRISPR-basierte Gentherapie verändert. Diese „kleine“ Nuklease ist klein genug, um in einen Adeno-assoziierten-Virus zu passen und wurde bereits mehrfach verwendet, um das Genom lebender Organismen zu editieren. Aufregend, oder? Sehen Sie sich das Video an, um mehr über CRISPR Cas9 zu erfahren! Was Sie erwartet:
- saCas9 Struktur
- saCas9 in vivo Performance
- saCas9 Krankheitsbehandlung
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CRISPR Cas9 vs. Cpf1: 5 Gründe, warum die Cpf1 Nuklease Cas9 überholt
Was ist der Unterschied zwischen CRISPR Cas9 und Cpf1? In dieser Episode erhalten Sie eine Einführung in die Cpf1 Nuklease, eine CRISPR Nuklease, die vom Zhang Labor entdeckt wurde und ab sofort bei Hölzel Diagnostika erhältlich ist. Cpf1 ist kleiner als Cas9 und richtet sich gegen komplementäre Genombereiche, was sie zu einer exzellenten Ergänzung zum CRISPR Dreamteam macht. Sehen Sie sich das Video an, um mehr darüber zu erfahren, warum Cpf1 eine eigene Fangemeinde verdient. Was Sie erwartet:
- Die Struktur von Cpf1
- Vorteile von Cpf1
- Unterschiede zwischen Cas9 und Cpf
- Möglichkeiten der Cpf1 Nutzung